中国是世界认识和利用食用菌最早的国家，最早可以追溯到年前的仰韶文化时期。数千年来，我国人民在和大自然相处过程中对大型真菌的形态、生境、习性进行了仔细的观察，创造了丰富的词汇，并作过许多描述，记载于历史、小说、农书、本草等各类书籍文献中，还以这些野生食用菌为题材，创作了许多优美的诗、词、歌、赋等。公元前年的《吕氏春秋》中记载了香菇的美味“味之美者，越骆之菌”，越骆即当今的浙江省香菇主产区，菌即香菇。从理论上阐明了菌类入馔的特点。晋朝王嘉（？~年）《拾遗记》有“种耨芝草”。古农书中关于种菌法的最早记载可以追溯到唐代韩鄂所著的《四时纂要》中“种菌子”的一段：“取烂构木及叶，于地埋之。常以泔浇令湿，两三日即生。”
黑木耳、香菇、草菇等多种食用菌栽培都是起源于我国。据考证，东南亚的草菇和日本的香菇栽培技术都是经由我国华侨和僧人传入。
多少年来，直至20世纪70年代，我国主要栽培的基本都是木腐菌—香菇、黑木耳、银耳。但多为砍树砍花自然接种的半人工栽培。70年代中后期才开始人工接种栽培。年统计全国食用菌产量仅6万吨(数据来自中国食用菌协会统计)。
欧洲、美洲、非洲等地也都有采集野生菌的习惯，如欧洲人对块菌、美味牛肝菌和鸡油菌情有独钟。英语的菌物学(mycology)一词则来源于蘑菇；古希腊将食用菌作为崇拜非洲人喜食野生的毛木耳、乳菇。